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载体DNA的保护伞——Plasmid-Safe™ ATP-Dependent DNase

酶是生物体非常重要的一类蛋白质,今天给大家介绍一款特色的DNA外切酶,以去除Fosmid等文库纯化过程中细菌基因组DNA的污染,一起来了解下吧~

在质粒,粘粒和BAC克隆载体等载体DNA的制备过程中,使用碱裂解法会产生细菌染色体DNA片段的污染。如果使用某些方法没有有效的去除污染DNA,那么污染的DNA会连接入克隆载体导致假阳性,高背景或错误的测序结果。实验室常规方法,如纯化柱或氯化铯离心不能有效的去除这些污染,因此还需要进一步的纯化。而Plasmid-Safe™ ATP-Dependent DNase可以选择性的去除质粒,粘粒和BAC克隆载体制备中污染的细菌染色体DNA(图1)。因此,Plasmid-Safe™ ATP-Dependent DNase是纯化质粒,粘粒和BAC克隆载体的理想选择。 

1.在大规模质粒,粘粒和BAC克隆载体制备中去除污染的细菌染色体DNA

2.消化线性DNA而不消化带切口或闭环的dsDNA或超螺旋DNA(质粒,fosmid等)

3.用作质粒,粘粒,fosmid,BAC载体和克隆制备物的最终纯化步骤

4.保护环状dsDNA

△图1. 从质粒制备物中去除污染的基因组DNA效果图

 

泳道2:500ng的未被切割的质粒DNA;

泳道4:Plasmid-Safe™ DNase处理后的染色体DNA和质粒DNA混合物;

△图2.消除产生白色菌落的线性DNA

 

3ug的EcoR I消化的细菌基因组DNA中加入2ug含有lacZ的超螺旋质粒载体。取一半混合物用Plasmid-Safe™ DNase处理;另一半不处理,作为对照。待Plasmid-Safe™ DNase热灭活后,将DNA用EcoR I处理,然后用T4DNA连接酶连接过夜,并转化到感受态细胞中,铺至含有IPTG/X-gal培养基上。用Plasmid-SafeDNase处理的DNA,只有1-3%菌落呈白色,而对照DNA白色菌落数大于50%。利用Plasmid-Safe™ DNase能消除几乎所有的线性DNA。

 

产品名称

规格

货号

Plasmid-Safe™ ATP-Dependent DNase

1,000 U @ 10 U/ul

E3101K

Plasmid-Safe™ ATP-Dependent DNase

1,0000 U @ 10 U/ul

E3110K