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MIRA结合Cas12a快速检测儿童呼吸道疾病

        急性呼吸道感染是儿童常见的呼吸道疾病,通常由病毒引起。呼吸道合胞病毒(RSV)和呼吸道腺病毒(ADV)是引起儿童急性呼吸道感染的两种常见病原体。轻度者可引起常见的感冒症状,如咳嗽和流鼻涕,而严重者可出现严重的并发症,如肺炎和中耳炎。根据世界卫生组织的建议,病原体的检测需要具备快速、准确、敏感、特异性的特点,不应依赖专门的技术人员或大型仪器。因此,开发一种能够满足上述检测要求的RSV和ADV的检测方法尤为重要。深圳儿童医院儿科研究所的马东礼主任课题组在《Scientific Reports》期刊上发表文章《A multiplex recombinase polymerase amplification assay combined with CRISPR/ Cas12a for the detection of respiratory syncytial virus and respiratory adenovirus》,影响因子4.6。

 

研究概述

将多酶恒温快速核酸扩增技术MIRA与CRISPR/Cas检测系统相结合。通过设计MIRA引物和CRISPR rna(crRNAs),多序列比较,优化反应条件,并使用荧光数值检测装置,验证灵敏度和特异性。并且以qPCR结果作为比较对照,研究了160例临床咽拭子样本的检测结果的一致性。

 

MIRA-CRISPR/Cas12a检测法检测步骤示意图)

实验结果

1.MIRA-CRISPR/Cas12a检测方法灵敏度和特异性

MIRA方法检测中,使用RSV-F1/R1引物对从RSV、ADV、PIV、RhV、MP、CP、FluB、hMPV、FluA或RSV/ADV合并感染患者的咽拭子样本中扩增核酸。除RSV和ADV有扩增条带,其他结果均为阴性,说明所选MIRA引物与检测的其他8种病原体未发生交叉反应,且保守性良好。随后,使用无菌水对RSV和ADV重组质粒进行10倍梯度稀释,对RSV和ADV的检测限均为106copies/mL。

 

1-10:分别为RSV、RSV/ADV合并感染患者咽拭子样本以及其他呼吸道病原体样本)

 

1-6:107102稀释质粒DNA;7:阴性对照)

2.与qPCR做对比

qPCR方法相比,RSV和ADV的检出限均为103copies/mL。

 

qPCR检测RSV和ADV的灵敏度)

MIRA-CRISPR方法更适合基层实验室,检测时间短,操作简单,无需大型qPCR仪器即可完成实验操作。

3.临床样本对比

从急性呼吸道感染的儿童中采集咽拭子样本160例。同时使用MIRA-CRISPR方法、qPCR方法进行检测,并将结果与临床试验结果进行比较。与qPCR方法相比,MIRA-CRISPR方法对RSV和ADV的敏感性分别为98.1%和91.4%,检测特异性均为100%。Kappa值大于0.95,表明其一致性程度较高。

 

 MIRA-CRISPR方法对RSV和ADV的检测具备快速、灵敏、特异性强的优势。它能及时准确地检测到病毒感染,更加适合于医疗资源匮乏的地区使用。

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安普未来生物介绍

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安普未来多酶恒温快速核酸扩增技术MIRA技术在恒温39°C-42°C下核酸扩增,反应时间仅为5-20 min。此外,不需要严格的实验室条件,应用场景多元化:综合医院检验科、基层医疗、居家检测、田间地头等。

试剂产品形态多样化:冻干粉、冻干微球等;显示结果的多样性:凝胶电泳、荧光曲线、胶体金试纸条等。试剂性能稳定、便于操作、方便存储运输。

并且安普未来生物以MIRA为核心平台技术研发出“超快速核酸释放技术”、“双通道恒温荧光检测仪”、“自测型核酸检测装置”等一系列配套产品,打造快速分子检测整体解决方案。

 

RPA试剂盒及试纸条系列:

货号

产品

规格

JY0209

双靶标HybriDetect侧向层析试纸条(彩虹型)

50T

JY0201

单靶标HybriDetect侧向层析试纸条(彩虹型)

50T

JY0307

Tiosbio® CRISPR单酶切及扩增产物检测试纸条

50T

JY0301

CRISPR Cas12/13 HybriDetect试纸条

50T

JY0308

Tiosbio® CRISPR双酶切检测试纸条(变色龙)

50T

WLB8201KIT

DNA恒温快速扩增试剂盒(基础型)

48T

WLE8202KIT

DNA恒温快速扩增试剂盒(荧光型)

48T

WLN8203KIT

DNA恒温快速扩增试剂盒(胶体金试纸条型)

48T

WLRB8204KIT

RNA恒温快速扩增试剂盒(基础型)

48T

WLRE8205KIT

RNA恒温快速扩增试剂盒(荧光型)

48T

WLRN8206KIT

RNA恒温快速扩增试剂盒(胶体金试纸条型)

48T

WLB5001

DNA恒温快速扩增试剂盒(液体基础型)

100T

WLN5002

DNA恒温快速扩增试剂盒(液体胶体金型)

100T

WLR5003

DNA恒温快速扩增试剂盒(液体荧光型)

100T

WLRB5001

RNA恒温快速扩增试剂盒(液体基础型)

100T

WLRN5002

RNA恒温快速扩增试剂盒(液体胶体金型)

100T

WLRE5003

RNA恒温快速扩增试剂盒(液体荧光型)

100T

 

Cas酶系列

货号

包装规格

中文名称

32108-01

100 pmoL

LbCas12a (Cpf1)

32108-03

1,000 pmoL

LbCas12a (Cpf1)

32117-01

100 pmoL

LwaCas13a (C2c2)

32117-03

1,000 pmoL

LwaCas13a (C2c2)

32118-01

100 pmoL

AapCas12b (C2c1)

32118-03

1,000 pmoL

AapCas12b (C2c1)

32119-01

100 pmoL

Un1Cas12f1 (Cas14a1)

32119-03

1,000 pmoL

Un1Cas12f1 (Cas14a1)

32104-01

100 pmoL

AsCas12a (Cpf1)

32104-03

1,000 pmoL

AsCas12a (Cpf1)

32116-01

100 pmoL

AacCas12b (C2c1)

32116-03

1,000 pmoL

AacCas12b (C2c1)

32106-01

100 pmoL

FnCas12a (Cpf1)

32106-03

1,000 pmoL

FnCas12a (Cpf1)

32110-01

100 pmoL

Lb5Cas12a (Cpf1)

32110-03

1,000 pmoL

Lb5Cas12a (Cpf1)

32101-01

100 pmoL

SpCas9

32101-03

1,000 pmoL

SpCas9

32102-01

100 pmoL

Sp-dCas9

32102-03

1,000 pmoL

Sp-dCas9

32120-01

100 pmoL

Sp-nCas9(H840A)

32120-03

1,000 pmoL

Sp-nCas9(H840A)