食源性病原微生物快速检测技术是实现全产业链食品安全的重要手段。基于CRISPR-Cas系统的新一代分子检测技术具有简便、准确、快速的优点。近日来自中国农业科学院家禽研究所的龚建森博士团队联合扬州大学、复旦大学和美国奥本大学的研究人员通过将LAMP等温扩增技术与CRISPR/Cas12b检测系统相结合,成功构建了适合肠炎沙门氏菌的一步法LAMP-CRISPR/Cas12b快检技术体系。该研究创新性地实现在一管内一步完成扩增加酶切反应,不仅突破了常规CRISPR检测两管开盖或一管两步的操作繁琐性,而且可以有效规避交叉操作及气溶胶污染对检测结果的影响。相关研究成果发表于Food Control(中科院1区,IF:6)的题为“Rapid and accurate detection of Salmonella enterica serovar Enteritidis using a one-step LAMP-CRISPR/Cas12b method”
检测流程
从样品中提取基因组DNA,直接加入预先配制工作溶液的反应管中进行检测。当存在目标核酸序列时可采集到荧光信号,不存在目标核酸序列时检测不到显著信号。
肠炎沙门氏菌LAMP-CRISPR/Cas12b检测系统工作流程示意图
研究成果
肠炎沙门氏菌(S. Enteritidis)作为一种全球流行的食源性病原体构成了重大威胁。及时的诊断方法是有效管理肠炎沙门氏菌感染的必要条件。为了快速、准确、便捷地检测肠炎沙门氏菌,研究人员建立了一步法LAMP-CRISPR/Cas12b检测平台,整个反应只需要45分钟,不需要专门的设备,具有100%的特异性,达到了每个反应30个拷贝的检测限。该检测平台对其他19种沙门氏菌血清型和9种非沙门氏菌致病菌具有100%的特异性,无交叉反应。与传统培养的方法进行比较发现一步法LAMP-CRISPR/Cas12b平台的肠炎沙门氏菌阳性率为2.88%(6/208),其中鸡肉为3.14%(4/127),鸭肉为4.44%(2/45),猪肉为0.0%(0/36),与传统培养方法的一致性为100%。该研究成果表明一步LAMP-CRISPR/Cas12b平台用于肠炎沙门氏菌检测的简便性和准确性,不仅为肠炎沙门氏菌的检测提供了一种简单,快速且准确的技术手段,而且为其他食源性病原菌的快速检测提供了新的解决方案,对于食品产业链的病原追溯,突发性食品安全事件的应急处置具有重要意义,在资源有限的多样化环境中具有潜在的应用前景。
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