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染色质免疫沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,简称ChIP)——ChIP-IT® Express 染色质免疫共沉淀试剂盒

染色质免疫沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,简称ChIP——ChIP-IT® Express 染色质免疫共沉淀试剂盒

       染色质免疫沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,简称ChIP)是研究体内蛋白质与DNA相互作用的一种技术。其原理是:在生理状态下用甲醛把细胞内的DNA与蛋白质交联在一起,通过超声或酶处理将染色质切为均一的小片段后,利用抗原抗体的特异性识别反应,使用DNA结合蛋白特异性的抗体将目的蛋白和DNA复合物沉淀下来。复合物经过洗涤,解交联,蛋白酶K消化去除DNA结合蛋白,经纯化得到感兴趣的DNA片段。纯化的DNA片段可用于后续的分析,比如qPCR,测序,ChIP-chipChIP re ChIP等。

       Active motif公司的ChIP-IT® Express试剂盒使用protein G包被的磁珠,代替传统的琼脂糖珠,使得ChIP实验可以在1天之内完成。试剂盒可以使用超声法或酶切法进行染色质的断裂处理。每种方法都提供快速、可重复的操作步骤,省时省力,实验者更容易获得成功的ChIP结果。

1 ChIP-IT® Express试剂盒的操作流程


ChIP-IT® Express试剂盒的优点

● 组分完整——提供ChIP实验所需的所有试剂;

● 可用于检测蛋白/DNA的相互作用,不仅仅限于组蛋白的修饰;

● 与全基因组分析或PCR相关的方法兼容;

● 无需进行试剂和操作步骤的优化;

● 无需酚/氯仿抽提步骤——试剂盒包含DNA纯化柱,可对DNA进行快速纯化

传统的ChIP实验都是使用染色质组成相关的抗体,如乙酰化组蛋白抗体。然而对于启动子转录活性分析而言,这无法揭示出是哪种转录因子结合到我们感兴趣的启动子上。相比之下,使用转录因子特异性抗体,能够直接监测转录因子和DNA的相互作用,但是这种技术与传统的ChIP相比具有更大的挑战,需要准备多种复杂的缓冲液,抑制剂混合物和封闭试剂等。而且在缺少抗体、对照和验证的实验流程下,很难对ChIP结果进行验证。为了解决这些问题,使得ChIP实验同时适用于转录因子和组蛋白,Active motif公司的ChIP-IT® Express试剂盒提供ChIP实验所需的所有试剂,包括阳性对照和阴性对照,使得研究者更容易成功的操作ChIP

图2: 改良的ChIP(使用ChIP-IT Express试剂盒)

PCR分析ChIP后的DNA。典型的ChIP实验每次需要2000,000个细胞,使用ChIP-IT Express试剂盒,仅需要100,000或更少的细胞既可获得阳性的ChIP结果。

1%的甲醛固定Hela细胞10分钟,使用超声法破碎染色质,使用阴性对照IgGRNA pol II抗体,对不同细胞数量来源(100,000750,000个细胞)的染色质进行ChIP,重复2次。使用阳性对照引物GAPDHChIP后的DNA进行36个循环的PCR分析(抗体和引物包含在人ChIP-IT对照试剂盒里,Active motif也可以提供小鼠和大鼠对照试剂盒)。取10ul PCR产物进行1%凝胶电泳,EB染色后紫外观察。结果显示与使用阴性对照IgG相比,使用RNA pol II抗体的ChIP大量富集了GAPDH启动子区域的DNA序列。

相关产品信息

 供货商

 产品编号

 产品名称 

 规格

 Active Motif

 53008

 ChIP-IT® Express

 25 rxns

 Active Motif

 53009

 ChIP-IT® Express Enzymatic

 25 rxns

除此之外,Active motif公司还提供特殊应用的ChIP试剂盒以及多种ChIP相关的的辅产品。


供货商

 产品编号

 产品名称

 规格

 产品说明

 Active Motif

 53014

 ChIP-IT® Protein G Magnetic Beads

 25 rxns

 Protein G包被的磁珠

 Active Motif

 53016

 Re-ChIP-IT®

 25 rxns

 双重ChIP

 Active Motif

 53018

 ChIP-IT® Express HT

 96 rxns

 高通量ChIP,一次可同时使用96分样本

 Active Motif

 53019

 Ready-to-ChIP Hep G2 Chromatin

 10 rxns

 即用型的ChIP实验用染色质

 Active Motif

 53020

 Ready-to-ChIP K-562 Chromatin

 10 rxns

 Active Motif

 53021

 Ready-to-ChIP NIH/3T3 Chromatin

 10 rxns

 Active Motif

 53015

Ready-to-ChIP HeLa Chromatin

 10 rxns

 Active Motif

 53026

 ChIP-IT® Control qPCR Kit – Human

 5 rxns

 ChIP对照试剂盒,包含阴性对照IgG和阳性对照

 RNA pol II抗体和PCR引物

 Active Motif

 53027

 ChIP-IT® Control qPCR Kit – Mouse

 5 rxns

 Active Motif

 53028

 ChIP-IT® Control qPCR Kit – Rat

 5 rxns

 Active Motif

 53010

 ChIP-IT® Control Kit – Human

 5 rxns

 Active Motif

 53011

 ChIP-IT® Control Kit – Mouse

 5 rxns

 Active Motif

 53012

 ChIP-IT® Control Kit – Rat

 5 rxns

 Active Motif

 53032

 ChIP-IT® Express Shearing Kit

 10 rxns

 超声法染色质处理试剂盒

 Active Motif

 53035

 ChIP-IT® Express Enzymatic Shearing Kit

 10 rxns

 酶切法染色质处理试剂盒

 Active Motif

 53040

 ChIP-IT® High Sensitivity

 16 rxns

 高灵敏ChIP试剂盒,适用于低丰度转录因子、

 低亲和力抗体或有限的样本

 Active Motif

 53041

 ChIP-IT® ChIP-Seq

 10 libraries

 ChIP-Seq剂盒

 Active Motif

 53045

 ChIP-IT® FFPE

 16 rxns

 适用于福尔马林固定,石蜡包埋组织样本的ChIP

 Active Motif

 53042

 ChIP-IT® PBMC

 16 rxns

 适用于外周血单核细胞的ChIP

 Active Motif

 53024

 RNA ChIP-IT®

 25 rxns

 用于研究RNA与细胞核染色质的相互作用

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